宏基因组学解析蚯蚓粪中微生物种群及耐药基因的组成

摘要：

为判定蚯蚓粪作为微生物肥料的潜力,本研究采用宏基因组学的方法,对污泥、牛粪与蔬菜蚯蚓粪样品抽提的DNA进行测序,并将结果进行物种注释及功能注释,以揭示不同蚯蚓粪中功能性微生物的种群结构.结果表明:污泥、牛粪和蔬菜蚯蚓粪分别检测到117505、81182、81104条scaftigs.变形菌门、拟杆菌门、疣微菌门与放线菌门为3种蚯蚓粪的优势菌门.氮磷代谢途径分析表明,蚯蚓粪中富含固氮菌(Rhizobium、Mesorhizobium、Bradyrhizóbium、Azospirillum)、硝化菌(Nitrosomonas、Nitrosospira、Nitrosococcus、Nitrospira)和溶磷菌(Flavobobacterium、Pseudomonas、Arthrobacter、Streptomyces)等肥料功能菌.相比而言,蔬菜蚯蚓粪微生物肥料潜力较高.相对于蔬菜蚯蚓粪(371条Unigenes),污泥(2461条Unigenes)和牛粪(965条Unigenes)蚯蚓粪中存在较多的病原菌.而且,污泥、牛粪与蔬菜蚯蚓粪中耐药基因相对丰度高达0.93×10-3、0.32×10-3和0.32× 10-3,主要为p-内酰胺类、氨基糖苷类、大环内酯类及四环素类耐药基因等.研究结果显示,蚯蚓粪中有益的功能菌群和有害微生物同时存在,其生物污染物的环境风险值得关注.

关键词：宏基因组、蚯蚓粪、微生物肥料、剩余污泥、牛粪、蔬菜废弃物

所属期刊栏目：40

分类号：X172(环境生物学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目;甘肃高等学校创新能力提升项目;兰州交通大学百人计划

在线出版日期：2021-03-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：5375-5382