基于iTRAQ技术荧蒽降解菌的比较蛋白质组学分析

摘要：

提取荧蒽不同诱导时间的红球菌BAP-1蛋白,应用iTRAQ技术结合LC-MS/MS对差异蛋白进行聚类以及生物信息学分析,以研究荧蒽高效降解菌的蛋白功能调控机理.结果表明:共鉴定到796个差异蛋白(差异倍数为2),其中表达上调的有613个,表达下调的有183个.3个比对组(3d/1d、6d/1d和8d/1d)共同差异表达蛋白为111个(上调56个,下调55个).通过COG、GO富集和pathway富集分析后发现绝大部分差异蛋白参与代谢和能量产生过程.在荧蒽诱导下上调关键蛋白有细胞色素C、三磷酸腺苷合成酶、二磷酸核苷等激酶,还有一些结合蛋白、脱氢酶、核糖体蛋白和趋化性蛋白等;下调显著的是5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸-同型半胱氨酸甲基转移酶.这些蛋白共同组成蛋白互作网络调控荧蒽降解菌的一系列生命活动.

关键词：iTRAQ、差异蛋白质组学、蛋白功能调控、多环芳烃、微生物修复

所属期刊栏目：38

分类号：X172(环境生物学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目41372232,41772234

在线出版日期：2018-03-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：284-292