基于转录组测序筛选鹿茸胸腺素促成骨细胞增殖基因

摘要：

目的 对Tβ4蛋白处理组和空白组进行转录组测序,筛选Tβ4蛋白处理后促成骨细胞相关的候选基因和通路.方法 通过Fmoc固相合成法体外合成梅花鹿Tβ4蛋白,并处理MC3T3细胞,CCK8法检测细胞活性.将细胞分为空白组和Tβ4处理组,利用Illumina平台进行高通量测序.对差异表达基因进行GO功能富集分类和KEGG通路分析,构建差异基因的蛋白互作网络并筛选Hub基因,通过在线软件对Hub基因进行富集分析.结果 Tβ4蛋白处理成骨细胞显著促进了细胞的增殖活性.获得差异基因6106个,其中上调基因1979个,下调基因4127个.根据PPI网络中的节点连通度,得到10个Hub基因,其中,筛选到7个与成骨细胞增殖相关的候选基因,分别为CDC20、PLK1、CDK1、BUB1B、BUB1、MAD2L1、RRM2,这些基因富集到了细胞周期信号通路和p53信号通路.结论 梅花鹿Tβ4蛋白处理后可以提高细胞的增殖活性和存活率.梅花鹿胸腺素Tβ4可能是通过调控细胞周期信号通路和p53信号通路中的关键基因达到促进成骨细胞增殖的功能.

关键词：鹿茸、胸腺素β4、转录组测序、细胞增殖、成骨细胞

所属期刊栏目：29

分类号：R932(生药学（天然药物学）)

资助基金：科技部重点研发计划项目2018YFC1706603

在线出版日期：2023-03-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：17-22