骨质疏松患者基因多态性与椎间盘退变的相关性研究

摘要：

目的 探讨分析骨质疏松患者基因多态性与椎间盘退变的相关性研究.方法 通过GEO数据库获取骨质疏松症(osteoporosis,OP)与椎间盘退变(intervertebral disc degenerative,IDD)的基因表达谱数据,分析两者的差异基因并取交集,再利用Cytoscape软件构建PPI网络,根据度值筛选出关键基因,并分析其与OP和IDD之间的关系.最后利用DAVID数据库分析关键基因在OP和IDD发生发展过程中的主要生物功能和信号通路.结果 在OP与IDD的发生发展中共有205个交集基因,其中UBC、YWHAZ、TP53、CUL3、NTRK1、BRCA1、Mcm2、ESR1为关键基因.GO功能分析与KEGG富集分析结果显示,与OP和IDD的发生发展过程密切相关的生物学过程主要涉及蛋白质-DNA复合物组合、蛋白质-DNA复合物亚基组织、蛋白质去泛素化、蛋白质小分子修饰、染色体组织的调控等,主要涉及PI3K/Akt信号通路、泛素介导的蛋白质水解、线粒体自噬、影响细胞周期及凋亡相关通路、神经营养素信号通路、甲状腺激素信号通路等.结论 OP与IDD之间存在着高度重合的差异基因表达,所涉及的基因功能和信号通路有助于了解两种疾病共同的发病机制,并为药物研发及治疗方式提供一定的参考.

关键词：骨质疏松症、椎间盘退变、生物信息学、基因芯片、高通量测序

所属期刊栏目：28

分类号：R34;R681.5(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：中医药传承与创新“百千万”人才工程岐黄工程—全国中医优秀人才研修项目;广西自然科学基金;广西高校青年教师基础能力提升项目;江西省中医药管理局科技计划项目

在线出版日期：2022-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：412-419