10.3969/j.issn.1006-7108.2022.03.015
类风湿关节炎与骨质疏松症的生物信息学分析
目的 利用生物信息学分析类风湿关节炎(RA)与骨质疏松症(OP)的关系.方法 通过Genecards、OMIM、TTD等数据库查找RA和OP的疾病基因,对两组疾病的基因取交集,将共同基因导入STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络图,使用R软件筛选出PPI网络中的关键基因,利用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析.结果 通过检索数据库筛选出RA相关基因5388个、OP相关基因4587个,取交集后获得共同靶点基因1899个,PPI网络图显示IL-6、INS、AKT1、TNF、TP53、VEGFA、EGFR等为RA与OP的共同关键基因,GO富集主要与受体配体活性、细胞因子受体结合、囊泡、T细胞活化、肽分泌的调节等相关,KEGG信号通路包括PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路、破骨细胞分化、细胞凋亡、Th17细胞分化等.结论 所获得RA与OP的共同关键基因和涉及的信号通路,有助于理解两者在疾病过程中的相关性,为药物的研发提供理论参考.
类风湿关节炎、骨质疏松症、生物信息学、信号通路
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R593.22;R681(全身性疾病)
国家自然科学基金;贵州省中医药;民族医药科学技术研究专项;贵州省高层次创新型人才培养计划-百层次人才项目;贵州省中医风湿免疫病临床研究中心黔科合平台人才号;贵州省中医药民族医药治疗风湿病医学平台建设黔科合平台人才20185707
2022-04-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
386-391,402