基于生物信息学分析骨质疏松症与阿尔茨海默症的相互关系

摘要：

目的 利用生物信息学分析骨质疏松症与阿尔茨海默症差异表达的miRNA及两病的相互关系.方法 利用GEO数据库获取骨质疏松症(osteoporosis,OP)与阿尔茨海默症(Alzheimer's disease,AD)的基因芯片,使用GEO2R在线分析得到OP与AD差异表达的微小核糖核酸(differentially expressed microRNA,DEmiRNA),将筛选后的DEmiRNAs用miRDB数据库和Targetscan数据库进行靶基因预测;用DAVID数据库对靶基因进行GO分析和KEGG信号通路分析,并结合STRING数据库,制作蛋白互作网络和DEmiRNAs-mRNA调控网络.结果 OP与AD的基因芯片中共有9个有意义的DEmiRNAs,通过蛋白互作网络筛选出前10个核心基因为:COL1A1、VEGFA、COL4A1、COL3A1、COL5A1、COL2A1、LOX、COL7A1、IGF1、COL5A2,同时发现hsa-miR-29b-3p和胶原蛋白在两病中的关系最为密切.结论 通过研究两种疾病DEmiRNAs与核心基因有助于了解OP与AD的相互关系,了解两病共同的发病机理,为两病治疗提供新的思路与方向.

关键词：骨质疏松症;阿尔茨海默症;生物信息学;微小核糖核酸

所属期刊栏目：27

分类号：Q811.4;R580;R749.16(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金;广州中医药大学"双一流"与高水平大学学科协同创新团队重点项目

在线出版日期：2021-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1576-1582