激素性股骨头坏死的关键基因筛选及发病机制探索:基于生物信息学分析

摘要：

目的:采用生物信息学方法筛选激素性股骨头坏死(SONFH)新的潜在标志物,并探索其相关发病机制.方法:选择GSE123568数据集中非SONFH组和SONFH组患者的外周血筛选差异表达基因(DEG).将筛选出的DEGs借助基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因富集分析(GSEA)来研究激素导致股骨头坏死过程中的表达通路.构建DEG的蛋白互作网络(PPI)并选出网络中最显著模块及关键基因.使用骨髓间充质干细胞对关键基因进行验证.结果:发现了402个DEGs,富集分析结果表明,DEGs主要富集在免疫反应和破骨细胞分化过程中.最后有8个基因被鉴定为关键基因,分别是TLR2、TYROBP、IRF8、SNCA、PECAM1、SLC4A1、HCK、CD14.选择TLR2、IRF8、HCK、CD14、SNCA和SLC4A1在细胞水平验证mRNA的表达,结果显示,地塞米松(DEX)处理后TLR2的表达并没有明显增加,而SNCA和SLC4A1的表达在DEX处理后上调,IRF8、HCK和CD14的表达在DEX处理后与之前一致.结论:TLR2、TYROBP、IRF8、SNCA、PECAM1、SLC4A1、HCK、CD14是SONFH发病过程中的关键基因.其中,IRF8、HCK和CD14可为SONFH新型治疗靶点的发现提供参考.脂多糖介导的免疫反应在SONFH的发生、发展过程中起到重要作用.

关键词：股骨头坏死、发病机制、差异表达基因

所属期刊栏目：16

分类号：R681.8(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)

资助基金：河南省中青年卫生健康科技创新优秀青年人才培养项目YXKC2021048

在线出版日期：2023-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：897-906