河北省一起新冠病毒感染疫情病毒全基因组特征及溯源分析

摘要：

目的 分析河北省本土新冠病毒感染(COVID-19)疫情病例新冠病毒(SARS-CoV-2)全基因组特征,结合流行病学开展溯源调查,为疫情的精准防控提供技术支撑.方法 对河北省2021年10-11月发生的一起本土疫情的部分COVID-19确诊病例,采集咽拭子标本,利用高通量测序技术开展病毒全基因组测序,分析病毒核苷酸和氨基酸序列变异特征.结果 共获得本起疫情相关的68条高质量病毒全基因组序列,均为Delta变异株AY.126进化分支.经比对,首发病例与同期内蒙古额济纳旗疫情病毒序列高度同源,仅有两个碱基存在差异,68条序列与武汉参考株(NC_045512)相比,核苷酸突变总数有44～48个,核苷酸突变类型以T转换为主;在S蛋白上发现D614G、L452R、T478K、P681R等10个氨基酸变异及2个氨基酸缺失.结论 对疫情早期病例、关键病例开展SARS-CoV-2全基因组测序,能指明流行病学调查方向,跟踪病毒基因变异特征,为疫情防控提供有力技术支撑.

关键词：新冠病毒、全基因组测序、溯源、变异特征

所属期刊栏目：47

分类号：R183;R563.1(流行病学与防疫)

资助基金：河北省省级科技计划项目;河北省省级科技计划项目;河北省三三三人才工程资助项目

在线出版日期：2024-05-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：179-182