江苏省淮安市啮齿动物感染正汉城病毒的基因特征研究

摘要：

目的 了解淮安市啮齿动物携带正汉城病毒(Seoul orthohantavirus,SEOV)的分布特点及SEOV的种群遗传多样性特征,为肾综合征出血热防治提供科学依据.方法 用夹夜法采集啮齿动物,提取肺组织RNA,采用PCR法扩增SEOV的S基因,对S基因序列进行系统进化及遗传多样性分析.结果 在淮安市捕获鼠类4种125只,褐家鼠(Rattus norvegicus)为优势鼠种,构成比为62.4％.褐家鼠携带的SEOV (XuyiRn43、XuyiRn68)S基因片段的核苷酸序列同源性为98.1％,推导的氨基酸序列同源性为97.5％,与江苏省赣榆株(GanyuRn20、GanyuRn66及GanyuRn137)的核苷酸序列同源性为98.4％～98.7％,推导的氨基酸序列同源性为96.7％～99.2％.系统进化分析显示淮安市褐家鼠携带的SEOV的基因亚型为S1型,有2个单倍型.结论 褐家鼠为淮安市优势鼠种,携带的SEOV为S1基因亚型.

关键词：啮齿动物、褐家鼠、正汉城病毒、基因分型、遗传多样性

所属期刊栏目：42

分类号：R512.8;R373.9(传染病)

资助基金：淮安市重点研发计划项目HAS201616

在线出版日期：2019-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：254-258,283