蚊类携带甲病毒属病毒CODEHOP RT-PCR检测方法的建立

摘要：

目的 建立蚊类感染甲病毒属病毒的CODEHOP RT-PCR检测方法.方法 依据甲病毒属病毒非结构蛋白氨基酸序列,设计1对CODEHOP引物,建立甲病毒属病毒一步RT-PCR检测方法,分析该引物在对不同种甲病毒基因序列上的结合位点及所能获得的产物序列大小;通过检测甲病毒属基孔肯亚病毒JC2012株,评价该方法的特异性和灵敏度;对JC2012扩增产物进行Blast同源性比对.结果 建立的CODEHOP RT-PCR方法可特异性扩增基孔肯亚病毒核酸,目的片段的大小与预期结果相符,核酸的最小检出量为56.7 pg.经Blast比对,结果与Genebank公布的CHIKV JC2012序列结果一致.同时从GenBank获得的22种甲病毒均存在CODEHOP引物结合位点,扩增产物大小在510～550 bp之间.结论 建立的甲病毒CODEHOP RT-PCR检测方法敏感、特异,可用于蚊类甲病毒感染检测.

关键词：甲病毒、一致一简并杂合寡核苷酸引物、检测

所属期刊栏目：37

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2014-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：181-185