广州市海珠区不同来源诺如病毒的基因分析

摘要：

目的 分析海珠区诺如病毒胃肠炎疫情的病原学特征及生蚝产品中诺如病毒携带情况.方法 使用实时荧光RT-PCR检测135份诺如病毒胃肠炎疫情、食物中毒肛拭子标本和130份市场出售的生蚝产品,测序后应用基因分析软件对核酸序列进行分析.结果 135份病例肛拭子中检出诺如病毒阳性73份,病例阳性率为54.1％(73/135);130份生蚝产品中检出诺如病毒阳性20份,阳性检出率为15.4％(20/130).经基因测序后,6条生蚝产品的自身同源性范围在98％～99％,属GⅡ-6型;采自7个流行现场的18个代表株都属于GⅡ组诺如病毒,但分别属于不同的基因型,有9株GⅡ-6型、1株GⅡ-5型、2株GⅡ-9型、6株GⅡ-17型.结论 海珠区内存在诺如病毒胃肠炎,流行优势株为GⅡ组,但基因型别存在多样性;在区内出售的生蚝产品存在诺如病毒污染,基因型为GⅡ-6型.

关键词：诺如病毒、急性胃肠炎、生蚝、实时荧光RT-PCR、基因型

所属期刊栏目：32

分类号：R373.25(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：广州市海珠区科技计划项目2013-yl-08

在线出版日期：2016-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：684-686,701