决策树联合生物标志在肺癌辅助诊断中应用
目的 检测p16、RASSFlA和脆性组氨酸三联体基因(FHIT)甲基化水平及外周血DNA端粒长度,建立并探讨判别分析与决策树2种分类模型在肺癌辅助诊断中的意义.方法 采用甲基化特异性PCR、实时荧光定量PCR法测定200名正常对照、200例肺癌患者外周血p16、RASSF1A和FHIT基因甲基化水平和DNA端粒长度,建立决策树、判别分析2种肺癌判别诊断模型.结果 肺癌组和对照组中p16、RASSFlA和FHIT基因启动子甲基化水平(%)分别为0.59(0.16~4.50)与0.36(0.06 ~4.00) (P =0.008)、27.62(9.09 ~ 52.86)与17.17(3.86 ~50.87) (P =0.038)、3.33(1.86 ~6.40)与2.85(1.39 ~5.44) (P=0.002);端粒长度分别为(0.93±0.32)和(1.16 ±0.57) (P <0.001),4项生物标志在2组间差异均有统计学意义;判别分析、决策树对预测集的预测准确度分别为64%、83%;ROC曲线下面积分别为0.640、0.830,差异有统计学意义(P<0.05).结论 数据挖掘工具建立的决策树模型判别诊断肺癌的效果优于判别分析.
肺癌、生物标志、决策树、辅助诊断
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R734.2(肿瘤学)
国家自然科学基金30972457,81001239;河南省重大科技攻关项目112102310102;河南省医学科技攻关计划项目2011020082
2013-11-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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