基于生物信息学途径研究CLDN4基因在卵巢癌中的作用及机制

摘要：

目的 基于生物信息学途径,研究紧密连接蛋白4(CLDN4)在卵巢癌中的作用机制.方法 从GEO数据库获取含有12个卵巢癌组织和正常组织的基因芯片,结合Oncomine数据库进行CLDN4 mRNA表达差异分析,筛选出差异基因109个,利用Cytoscape 3.8.2软件进行GO富集和KEGG富集分析,String数据库进行蛋白相互作用网络分析,找到关键节点蛋白16个,选取差异最大的CLDN4基因进行深入探讨,进行表达分析和GeneMANIA功能预测.结果 筛选109个差异基因进行GO富集和KEGG信号通路分析,发现参与Wnt/β-catenin、MAPK、MEK-ERK等信号通路;构建功能模块,找到关键蛋白16个,其中CLDN4 mRNA在卵巢癌中高表达,CLDN4表达与临床分期和生存状态有相关性;预测CLDN4基因在功能上与顶端连接复合体、细胞-细胞连接、内皮屏障的建立、内皮细胞发育与分化等有关.结论 CLDN4在卵巢癌中高表达,在癌细胞的增殖、转移中有一定作用,有望成为诊断和治疗卵巢癌的新生物标记物.

关键词：卵巢肿瘤、紧密连接蛋白、Oncomine数据库、TCGA数据库、GEO数据库

所属期刊栏目：38

分类号：R737.31(肿瘤学)

资助基金：河北省医学科学研究课题;华北理工大学大学生创新创业训练项目

在线出版日期：2023-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：983-988