不明原因复发性流产患者的基因表达谱亚组分析

摘要：

目的 探讨不明原因的复发性流产(RSA)患者的基因表达谱的异质性,确定亚组子宫内膜生物学过程的区别.方法 从GEO数据库中获取GSE165004和GSE26787基因表达序列,应用ComBat方法去除批次效应后,应用Consensus Cluste-ring方法对29个病例组进行无监督聚类并分成3个亚组(RSA1、RSA2、RSA3),3个亚组再分别与对照组进行差异表达分析.利用GO富集和KEGG富集对差异表达基因(DEGs)进行生物学功能和途径注释.应用cytoHubba识别中心基因.结果 RSA1和对照组主要富集在与核分裂、细胞分裂等细胞周期相关,代谢途径有蛋白质消化吸收和细胞外基质(ECM)受体相互作用;RSA2组和脂质、氨基酸代谢过程的调控有关,代谢途径主要有花生四烯酸代谢和甲状腺激素合成;RSA3组和金属离子等细胞信号有关.结论 RSA1亚组的细胞周期明显失调;RSA2亚组的脂质、氨基酸代谢失调;RSA3亚组的细胞信号失调.

关键词：复发性流产、亚组分析、批次效应、一致性聚类

所属期刊栏目：37

分类号：R714.21(妇产科学)

在线出版日期：2022-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：3629-3634