慢性宫内缺氧程序性控制子鼠骨骼肌基因差异表达

摘要：

目的 筛选慢性宫内缺氧(CIH)子代大鼠骨骼肌差异表达基因(DEGs)并进行生物信息学分析.方法 20只孕鼠随机分为宫内缺氧组及常氧组,取新生雄鼠股四头肌行数字化基因表达谱(DGE)测序筛选DEGs,进行Gene Ontology及KEGG Pathway分析.实时荧光定量PCR验证测序结果可靠性.结果 ①测序reads分布、饱和度及随机性显示测序质量良好.②CIH后DEGs达396个,其中上调表达基因287个,下调109个.GO功能注释表明,DEGs主要集中在细胞组分、胞外区、封闭的膜腔等部位,具有结合、催化、转运等活性,参与发育过程、代谢过程、生物调节等多个生物学过程.Pathway富集分析显示DEGs主要集中在三大营养物质代谢、Insulin信号通路、PPAR信号转导通路.③实时荧光定量PCR验证DEGs上调或下调趋势与DGE结果基本一致.结论 CIH能程序性控制子鼠骨骼肌基因表达,其中糖脂代谢调节是CIH相关的成年期慢性代谢性疾病的主要分子基础.

关键词：慢性宫内缺氧、大鼠、数字化基因表达谱、生物信息学、代谢

所属期刊栏目：31

分类号：R-332(医学研究方法)

资助基金：国家自然科学基金81271587

在线出版日期：2016-03-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：378-381