10.19982/j.issn.1000-6621.20220298
宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌肺病的诊断价值
目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在非结核分枝杆菌肺病(nontuberculous mycobacterial pulmonary disease,NTM-PD)中的诊断价值.方法:回顾性搜集 2020 年 1 月至2022年2月浙江大学医学院附属杭州市胸科医院结核病诊疗中心收治的123例疑似NTM-PD患者的资料.根据诊断标准,123例疑似NTM-PD患者最终诊断为NTM-PD患者(NTM-PD组;74例)和非NTM-PD患者(非NTM-PD组;49例).123例患者肺泡灌洗液、痰液、肺组织同时进行mNGS、PCR荧光探针法、BACTEC MGIT 960分枝杆菌全自动快速液体培养(简称"液体培养"),比较3种方法的诊断效能.结果:以最终临床诊断结果为标准,mNGS、液体培养及PCR荧光探针法检测NTM-PD的敏感度分别为83.8％(62/74)、78.4％(58/74)、67.6％(50/74),特异度分别为 65.3％(32/49)、91.8％(45/49)、87.8％(43/49),诊断一致率分别为 76.4％(94/123)、83.7％(103/123)、75.6％(93/123),Kappa值分别为 0.524、0.647、0.521.以液体培养结果为标准,mNGS和 PCR荧光探针法检测NTM-PD的敏感度分别为87.1％(54/62)和75.8％(47/62),特异度分别为59.0％(36/61)和85.2％(52/61),诊断一致率分别为 73.2％(90/123)和 80.5％(99/123),Kappa 值分别为 0.462 和 0.587.对 74 例NTM-PD患者菌株进行mNGS及基因芯片法菌种鉴定,以基因芯片法为菌种鉴定标准,mNGS检测的准确率为63.8％(37/58).结论:在NTM-PD的诊断中,mNGS检测的敏感度较高,可直接鉴定至菌种水平,但特异度较低,应重点提高检测特异度,以更好地服务于临床工作.
基因组学、分枝杆菌、非典型性、诊断技术和方法、对比研究
44
R563(呼吸系及胸部疾病)
国家自然科学基金82104236
2022-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
1135-1140
