肺结核患者肺组织微生物组特征研究

摘要：

目的 探讨肺结核患者肺部病灶坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物组基本特征.方法 选取2016-2017年首都医科大学附属北京胸科医院10例临床及病理确诊为肺结核患者的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的组织标本,通过显微切割技术分别获得FFPE组织的坏死区、肉芽肿区和正常肺区.采用高通量测序的方法,检测其微生物组特征.结果 肺结核患者肺部切除标本中主要的微生物类群(门水平,相对丰度＞1％)有Proteobacteria、Actinobacteria、Firmicutes、TM7和Bacteroidetes.在门水平上,坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物群落组成未见差异.在属水平上,主要有7个类群(相对丰度＞1％):坏死区、肉芽肿区、正常肺区相对丰度Ochrobactrum分别为(50.70±6.76)％、(56.18±7.50)％、(61.31±7.95)％;Sphingomomas分别为(7.50±2.07)％、(7.69±1.29)％、(3.81±2.08)％;Corynebacterium分别为(5.39±2.39)％、(5.23±1.39)％、(7.43±3.56)％;Brevundimonas分别为(1.67±0.42)％、(1.75±0.67)％、(2.09±0.34)％;Brevibacterium分别为(2.38±2.23)％、(2.60±2.60)％、(2.29±0.64)％;Sphingobacterium分另别为(0.72±0.31)％、(0.78±0.26)％、(1.20±0.38)％和Enhydrobacter分别为(1.25±1.28)％、(0.31±0.19)％、(0.67±0.80)％.基于Bray-Curtis距离的Adonis分析结果表明,在属水平上,坏死区和正常肺区,肉芽肿区和正常肺区中微生物群落组成差异有统计学意义(F值分别为3.94和4.76,P值分别为0.005和0.002).Mycobacterium的相对丰度非常低,主要存在于肺结核病灶的坏死区[(0.81±1.92)％].配对样品检验结果表明Mycobacteri um的相对丰度在坏死区[(0.81±1.92)％]和肉芽肿区[(0.01±0.01)％]、坏死区和正常肺区[(0.01±0.02)％]中差异有统计学意义(Z值分别为2.10和-2.37,P值分别为0.036和0.018).结论 结核病患者肺部自坏死区、肉芽肿区到正常肺的组织变化中,Sphingomonas、Enhydrobacter、Kocuria和Mycobacterium的相对丰度整体呈下降趋势,而Ochrobactrum和Sphingobacterium的相对丰度总体呈上升趋势.肺结核患者肺部菌群的变化特征可能与肺结核的发病有重要关系.

关键词：结核、肺、活组织检查、石蜡包埋、高通量核苷酸测序、微生物组

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在线出版日期：2018-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1152-1158