利用高通量转录组测序对肺鳞癌基因型的研究

摘要：

背景与目的 目前尚无有效的靶向药物用于肺鳞癌的临床治疗,在肺腺癌中有效的靶向药物却无法让鳞癌患者获益,而研究者对肺鳞癌的靶点知之甚少.本研究重点筛选并鉴定肺鳞癌的特异关键基因,为肺鳞癌的治疗提供新的靶点.方法 转录组测序检测5例肺鳞癌患者的配对肺癌组织及正常肺组织样本,使用生物信息学分析筛选两组之间的差异编码基因,进而应用实时定量PCR验证关键差异基因在肺癌细胞系的表达情况.结果 转录组测序结果显示,与正常肺组织相比,肺鳞癌组织上调的差异基因数目为534条.位于前十位肺癌组织高表达的基因包括GAGE12J、SPRR3、PRAME、SPRR1A、SPRR2E、MAGEA3、SPRR1B、IL36G、TMPRSS11D和SPRR2D.进而于不同生物特征的肺癌细胞系H520、GLC82、A549、H1299及PC9验证SPRR家族表达状态,我们发现在淋巴结转移细胞系H1299处于高表达水平.结论 高通量转录组测序筛选到肺鳞癌异常高表达基因SPRR家族,此家族与肺癌淋巴结转移相关,为肺癌的靶向治疗提供了新的思路.

关键词：肺肿瘤、高通量测序、SPRR家族

所属期刊栏目：20

分类号：R73;R97

资助基金：北京大学"临床医院合作专项"以及北京市医馆局临床医学发展专项-"扬帆"计划No.ZYLX201509项目支持 This study was supported by the grants from Peking University PKU 985 Special Funding for Collaborative Research with PKU Hospitals and Beijing Municipal Administration of Hospitals Clinical Medicine Development of Special Funding Support to Yue YANGZYLX201509

在线出版日期：2017-12-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：727-731