miR-429对抽动障碍靶基因调控的生物信息学分析
目的 通过生物信息学分析,并将miR-429靶基因与抽动障碍(TD)相关基因(TRGs)关联,预测TD相关靶基因,以更好地理解miR-429在TD中的作用.方法 通过miRbase数据库获取多物种成熟miR-429的序列,进行保守性分析.通过GeneCards和DisGeNET数据库获取TRGs,并将miRDB数据库及DIANA数据库的microT工具预测的miR-429的靶基因与TRGs取交集获得TD相关靶基因.运用RNAhybird数据库对杂交的位点序列和最小自由能(MFE)进行预测.通过DAVID数据库对TD相关靶基因进行功能富集分析.结果 miR-429的22个核苷酸中仅2个核苷酸在物种间存在差异,总共获得9个基因为TD相关靶基因.仅ASH1L、SLITRK 1与miR-429杂交的序列中未包含物种间存在差异的核苷酸,最小的杂交MFE的基因为CHD2(-25.0 kcal/mol).功能富集分析各分类的首个功能术语为生物学过程的成人行为,细胞组分的谷氨酸能突触,以及分子功能的染色质结合.未获得有统计学意义的通路富集.结论 miR-429可能通过相关基因调控谷氨酸能突触而影响TD行为,尤其是SLITRK1基因.
miR-429、谷氨酸能、SLITRK1基因、生物信息学分析、抽动障碍
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R749.94(神经病学与精神病学)
福建省自然科学基因;福建医科大学启航基金项目
2023-05-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
268-273
