维甲酸诱导小鼠神经管畸形胚脑中H2BK120ub1的全基因组状态变化
目的 利用染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)分析E10.5 d正常小鼠胚脑组织与维甲酸(RA)诱导神经管缺陷(NTDs)小鼠胚脑组织H2BK120单泛素化(H2BK120ub1)修饰的全基因图谱,以期发现H2BK120ub1修饰与神经管发育通路基因表达的关系,为NTDs的诊断及治疗提供生物学靶点及依据.方法 孕鼠分为随机对照组和RA诱导的NTDs组,利用ChIP-seq技术对获得的H2BK120ub1特异结合DNA片段进行序列鉴定,获取比对Reads,进行全基因组的Peak分析、基因注释(GO)以及功能富集分析peak相关基因的生物学功能.结果 E10.5 d正常小鼠脑组织和RA诱导神经管畸形小鼠脑组织两组间有306个基因有显著的H2BK120ub1差异,根据GO富集的基因个数进行统计:在cellular component 中前三位为别为 Cell(82 个基因),Cell part(82 个基因),Organelle part(52 个基因);在 biological process 中前三位为别为 celluar process(68 个基因),metabolic process(47 个基因),biological regulation(40 个基因);KEGG通路分析的结果主要富集于刺猬因子(HH)信号通路、TGF-beta信号通路、Wnt信号通路等参与调控神经管发育的关键信号通路,有显著统计学意义(P＜0.05).结论 H2BK120ub1修饰的差异可作为NTDs的一个潜在的诊断及治疗靶点.
维甲酸、H2BK120ub、神经管缺陷、染色质免疫共沉淀测序技术
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R748(神经病学与精神病学)
国家自然科学基金;首都儿科研究所所级基金;首都儿科研究所所级基金;北京市医管中心使命人才培养计划项目
2022-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
731-736
