变应性鼻炎中lncRNA-miRNA-mRNA网络构建与相关程序性细胞死亡基因的分析

摘要：

目的 本研究旨在探讨lncRNA介导的ceRNA网络在变应性鼻炎(AR)病理生理过程中的作用及其在程序性细胞死亡(PCD)中的潜在调控功能.方法 纳入AR患者与正常人,取全血进行RNA测序分析,筛选差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA用于构建基于ceRNA理论的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络.采用基因本体(GO)和KEGG富集分析来预测ceRNA网络中mRNA的潜在生物学功能.随后,将差异表达的mRNA与PCD相关基因相互取交集,并依据交集mRNA构建新的ceRNA网络,同时对ceRNA网络中mRNA进行靶器官定位网络分析.结果 基于生物信息学分析,共提取5个lncRNA、4个miRNA和46个mRNA,构建AR中lncRNA介导的上调及下调的ceRNA网络.功能富集分析显示其在"钙信号通路"、"PI3K/AKT信号通路"及"ERK1和ERK2级联"等中显著富集.并对AC008394.1及人类组织相容性白细胞抗原复合物P5(HCP5)2个lncRNA构建PCD相关ceRNA调控网络.在对ceRNA网络中mRNA进行靶器官定位分析中发现,它们多在神经免疫相关器官中表达.结论 本研究构建了 AR中新的ceRNA网络,初步探索了 HCP5介导的ceRNA网络可能通过影响细胞凋亡对AR发挥作用.为AR发病机制的研究提供了新的见解和潜在的研究方案.

关键词：变应性鼻炎、lncRNA、ceRNA网络、程序性细胞死亡、人类组织相容性白细胞抗原复合物P5

所属期刊栏目：29

分类号：R765.21(耳鼻咽喉科学)

资助基金：北京中医药大学附属医院校级课题2021-BUCMXJKY010

在线出版日期：2023-07-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：54-63