基于Web服务的禽流感病毒基因分析软件FluSoft的创建与应用

摘要：

解读病毒基因组信息是探明病毒关键分子特性的重要步骤.然而,解码基因信息,需要在较强的生物信息学背景下,查阅大量文献、选择参考序列、开展序列比对、进行遗传进化分析、验证并集成数据信息等,其过程工作量大、耗时、技术含量高.为解决上述问题,采用Perl语言集成一系列软件和数据集,创建了禽流感病毒基因分析软件(FluSoft),实现了禽流感病毒基因组快速批量注释和分析.本软件通过Web网页对话框输入FASTA格式的禽流感病毒基因序列,可进行关键生物特性和遗传进化分析,实现了以下功能:(1)注释查询序列的基因片段/亚型(针对H5或H7亚型,增加展示其HA基因裂解位点氨基酸序列及碱性氨基酸个数)及基因突变的生物学意义,如耐药性、宿主受体特异性、毒力、糖基化位点及在家禽或哺乳动物中的传播能力等;(2)注释查询序列在命名系统中最密切相关的演化分支.综上所述,FluSoft软件(http://flusoft.hqhuitong.com)为禽流感流行病学调查监测、流行特征分析及风险预警提供了有力的技术支撑.

关键词：禽流感病毒、基因分析、生物特性、遗传进化、FluSoft软件

所属期刊栏目：40

分类号：S855.9(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划2022YFF0802404

在线出版日期：2023-02-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：146-152