2021—2022年我国8株鸽新城疫病毒基因组特征

摘要：

为了解我国最新流行的鸽新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)分子生物学特征,对2021—2022年国家新城疫参考实验室从不同地区鸽群中分离到的8株NDV代表株进行了全基因组测序和生物信息学分析.结果显示:8株鸽NDV基因组长度均为15192 nt,基因排列方式为3'-NP-P-M-F-HN-L-5',其F蛋白裂解位点氨基酸序列均为112RRQKR/F117,呈典型的NDV强毒分子特征;相较于参考序列,代表毒株F蛋白七肽重复区域、融合肽和跨膜区域,以及HN蛋白中和抗原表位、跨膜区域等功能区域均有多处氨基酸变异;代表毒株全基因组核苷酸同源性为91.9％～99.0％,均属于ClassⅡ基因VI型病毒,但可分为2个小分支,其中4株属于基因VI.2.1.1.2.2亚型,另4株属于基因VI.2.1.1.2.1亚型.结果表明,我国近期流行的鸽NDV具有遗传多样性特征.本研究进一步掌握了我国鸽NDV的遗传进化特点,丰富了鸽新城疫的流行病学信息,为该病的科学防控提供了参考.

关键词：鸽新城疫病毒、遗传进化分析、氨基酸变异

所属期刊栏目：40

分类号：S852.4(动物医学（兽医学）)

资助基金：山东省重点研发计划项目2022CXGC010606

在线出版日期：2023-02-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

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