口蹄疫病毒O型泛亚株VP1蛋白的二级结构及抗原表位预测

摘要：

为获得口蹄疫病毒(FMDV)O/PanAsia毒株VPl蛋白的抗原信息,从而为制备多肽疫苗提供理论依据,运用生物信息学软件,对O/PanAsia毒株的结构蛋白VP1理化性质、结构功能以及细胞表位进行分析,预测抗原表位以选择合适肽段.应用ProParam、TMHMM Server、ProScale和SignaIP等在线工具,分析VP1蛋白氨基酸序列,运用计算机技术和分子生物学软件,分析预测VP1蛋白的基本理化性质、结构功能以及可能的B细胞和T细胞抗原表位,筛选B细胞表位肽段并对VP1的两个主要T细胞表位CTL和Th细胞表位进行预测.结果显示:O/PanAsia毒株VP1蛋白的等电点为9.49,相对分子质量为23520.83;VP1蛋白的B细胞表位为8～23、135～149和193～205位氨基酸.预测该VP1有10个CTL和10个Th细胞抗原表位,表明其具有较好的免疫原性;最终筛选出VP1蛋白的5个CTL和5个Th优势表位.用生物信息学方法预测O/PanAsia毒株VPl蛋白为稳定性蛋白,含有T、B淋巴细胞抗原表位.本研究为FMDV的进一步研究和疫苗制备奠定了基础.

关键词：口蹄疫病毒;VP1蛋白;理化性质;抗原表位

所属期刊栏目：38

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划项目2017YFD0500903

在线出版日期：2021-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：101-109