甲型流感病毒快速分型与分析软件的开发与试用

摘要：

甲型流感病毒危害动物和人类健康,其亚型多、突变率高、易发生重配,因此对其进行检测及流行毒株基因分析尤为重要.为解决传统方法进行大量甲型流感病毒序列分型和分析时存在的费工耗时、人为错误多等问题,结合实际工作需要,使用Perl语言建立了一套lunix系统下的甲型流感病毒快速分型与分析软件,并试用其对GenBank中所有宿主为鸭的甲型流感病毒进行了分析.结果显示,该软件可在较短的时间内完成大量序列的分析、分型和遗传进化研究,可用于甲型流感病毒的大规模流行病学调查分析.

关键词：甲型流感病毒、基因分析、亚型、遗传进化

所属期刊栏目：33

分类号：S858.28(动物医学（兽医学）)

资助基金：科技部科技基础性专项SQ2012FY3260033;中国动物卫生与流行病学中心创新基金2015IF-0004FF

在线出版日期：2016-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：80-84