新城疫病毒TL1株P基因的克隆及序列分析

摘要：

根据GenBank登陆的新城疫病毒P基因序列,设计了一对引物,用RT-pCR技术对新城疫病毒内蒙古分离株TL1的P基因进行了扩增.将扩增产物提纯后克隆入pGEM-T easy载体,通过酶切、PCR和测序验证克隆正确.测序拼接得出P基因的序列长度为1248 bp,该基因的ORF总长为1188 bp,编码395个氨基酸.与GenBank下载的12株参考毒株比较P基因编码区全核苷酸序列和氨基酸序列,发现TL1株与鹅源新城疫NA-1株核苷酸的同源性为99.8%,氨基酸的同源性为99.2%;与鹅源新城疫ZJ1株核苷酸的同源性为96.1%,氨基酸的同源性为95.5%,说明TL1株和与鹅源新城疫NA-1株、ZJ1株的同源性极高,它们三者亲缘关系较近,同属于基因Ⅶ型新城疫病毒.而与传统疫苗株LaSota核苷酸的同源性为83.4%,氨基酸的同源性81.8%,说明该毒株相对于经典的NDV在P基因上已发生了较大的变异.

关键词：新城疫病毒、P基因、序列分析

所属期刊栏目：24

分类号：R3(基础医学)

资助基金：军事医学科学院基金;吉林省科技厅科技发展计划20050549

在线出版日期：2007-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：32-34