亚砷酸钠致人肝星状细胞纤维化及自噬中DNA甲基化位点筛查及差异甲基化谱构建

摘要：

目的:分析亚砷酸钠（NaAsO
2）致人肝星状细胞（LX-2细胞）纤维化及自噬相关的DNA甲基化位点，筛选与纤维化及自噬相关的特异性甲基化基因。
方法:采用DNA甲基化芯片Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChips（850K甲基化芯片）对LX-2细胞（对照组）及NaAsO
2干预（低、中、高剂量组：终浓度分别为5、10、15 μmol/L NaAsO
2，干预48 h）致LX-2细胞纤维化及自噬模型进行全基因组DNA检测，寻找差异甲基化位点。对筛选出的差异甲基化基因进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析，了解基因功能。
结果:高剂量组细胞纤维化及自噬模型构建成功。850K甲基化芯片检测结果显示，高剂量组与对照组间存在25 817个显著差异甲基化位点，其中高甲基化位点12 083个、低甲基化位点13 734个。GO功能富集分析显示，差异甲基化基因参与的分子功能主要包括蛋白结合、离子结合、催化活性、酶结合。KEGG信号通路富集分析显示，差异甲基化基因参与的通路主要包括代谢通路、癌症通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、内吞作用、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路。进一步在启动子区，筛选出11个与纤维化相关的差异甲基化基因和29个与自噬相关的差异甲基化基因。结论:NaAsO
2诱导LX-2细胞纤维化及自噬过程中存在大量差异甲基化位点，筛选出与纤维化及自噬相关的特异性甲基化基因。

关键词：亚砷酸盐类、人肝星状细胞、肝纤维化、自噬、DNA甲基化

所属期刊栏目：42

资助基金：国家自然科学基金82160650;国家卫生健康委微量元素与地方病重点实验室开放课题XJ2022G165;新疆维吾尔自治区研究生科研创新项目82160650;National Natural Science Foundation of ChinaXJ2022G165;Open Subject of Key Laboratory of Trace Elements and Endemic Diseases of the National Health Commission;Xinjiang Uygur Autonomous Region Graduate Student Scientific Research Innovation Project

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：11-16