大骨节病和骨性关节炎差异基因的互作网络分析研究

摘要：

目的 采用蛋白互作网络分析研究基因芯片数据,构建大骨节病(Kashin-Beck disease,KBD)和骨性关节炎(osteoarthritis,OA)差异基因互作网络图并对筛选的网络进行分析.方法 依据《大骨节病诊断》标准,选择Ⅱ和Ⅲ度KBD患者8例,WOMAC诊断OA 7例,经关节清理术和关节置换术收集关节软骨,采用美国安捷伦4×44K基因芯片进行差异基因筛选;将筛选出差异表达＜或＞2倍的1 055个差异基因的表达数据导入STRING 9.1在线数据库进行分析,绘制差异基因互作网络图,并将互作网络数据导出到Cytoscape 3.2.1软件中,筛选出网络中心节点.采用KEGG等数据库进行信号通路分类及基因功能研究,并用实时荧光定量PCR(RT-PCR)进行验证.结果 ①334个KBD和OA差异基因编码的蛋白经STRING 9.1筛选存在相互关系,并构成互作网络图;②Cytoscape 3.2.1对网络的中心节点进行分析,筛选出10条以上通路的中心节点基因约150个,主要涉及线粒体功能、骨代谢及炎性因子等多条信号通路.结论 本研究构建出KBD与OA的差异基因互作网络,尤以网络中心节点差异基因为特点,对KBD与OA发病机制的异同、早期诊断及靶向治疗均具有重要意义.

关键词：大骨节病、骨性关节炎、互作网络、中心节点

所属期刊栏目：35

分类号：TP393;R687.4;R2-03

在线出版日期：2016-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：472-476