2009～2014年度浙江南部呼吸道合胞病毒分子流行病学研究

摘要：

目的 了解浙江南部呼吸道合胞病毒(RSV)基因型流行趋势,并研究A亚型G蛋白基因特征.方法 采集2009年7月至2014年6月浙江南部3家医院因肺炎和毛细支气管炎住院的5岁以下儿童下呼吸道分泌物,应用直接免疫荧光法检测RSV抗原.在每个流行年度(7月至次年6月)RSV阳性标本中随机抽取200份,应用RT-PCR方法检测RSV亚型,扩增A亚型G蛋白近全基因序列并测序,鉴定其基因型.结果 2009～20145个年度共采集25449份下呼吸道分泌物标本,其中6416份(25.21％) RSV阳性.随机抽样的1000份RSV阳性标本中检出A亚型462株(46.2％),B亚型538株(53.8％),A亚型依次占各年度的22.5％、74.5％、84.5％、19.0％、30.5％.每年度随机抽样25株RSV A亚型病毒株外送双向测序,结果获得A亚型阳性52株,其中得到4种A亚型基因型,包括NA1(39株)、NA4(1株)、ON1(10株)、GA2(2株)基因型,其中NA1是2009～2012年度的优势基因型,ON1是2013～2014年度A亚型的唯一基因型.A亚型G蛋白基因与原型株A2的核苷酸同源性为80.7％～89.3％,氨基酸同源性为74.4％～82.6％;分离株之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为81.5％～100％和80.2％～ 100％.结论 2009～2014年度浙江南部地区出现RSV A、B亚型共循环,A亚型有多个不同的基因型共循环,其G蛋白基因变异明显.

关键词：呼吸道合胞病毒、G蛋白、亚型、基因型、儿童

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资助基金：浙江省公益性技术应用研究项目2012C33049;国家临床重点专科开放项目20140105

在线出版日期：2018-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：904-910