miRNA-126*靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析

摘要：

目的 通过对miRNA-126*进行靶基因预测及信号通路生物信息学分析,以期为miRNA-126*靶基因相关实验及其调控肺发育机制的深入研究奠定基础.方法 首先利用microRNA (miRNA)芯片技术分别检测胎龄16 d、19 d和21 d胎鼠肺组织中miRNA-126*的表达水平,进而应用miRGen2.0数据库通过生物信息学方法预测其可能的靶基因,然后对其靶基因集合应用Cytoscape及其插件BiNGO进行功能富集分析(GO-analysis),最后应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析(KEGG Pathway analysis).结果 miRNA-126*表达量在胎龄16 d、19 d和21 d3组胎肺组织间逐渐上升.miRNA-126*预测靶基因共有422个,其靶基因集合功能富集于葡萄糖醛酸转移酶、糖代谢等分子功能,多细胞器官发育、发育进程等生物学过程及细胞分隔、细胞器界膜等细胞组分上.信号转导通路则显著富集于RNA降解信号通路,以及朊蛋白疾病信号通路中.结论 本研究结果提示miRNA-126*参与了大鼠胎肺发育过程,为今后研究肺发育提供理论基础.

关键词：miRNA-126*、生物信息学、肺发育、大鼠

所属期刊栏目：15

资助基金：江苏省卫生厅面上项目H200642

在线出版日期：2013-05-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：227-232