牦牛死亡结构域蛋白(FADD)基因克隆与生物信息学分析

摘要：

死亡结构域蛋白(FADD)是在生物细胞里起到信号转导作用的一种蛋白,在胚胎发育、细胞凋亡过程中发挥重要的生物学活性.实验以成年母牦牛的卵巢RNA为模板,利用RT-PCR技术克隆牦牛FADD基因,并进行了生物信息学分析.结果表明:牦牛FADD基因CDS区长度630 bp,编码209个氨基酸,蛋白分子式C996H1632N300O307S7,整个蛋白质带负电荷,总共原子数量3242;分子质量23.0 ku,半衰期30 h;理论等电点6.11;消光系数18240;不稳定指数49.08,属于不稳定蛋白;脂肪系数104.64,平均亲水系数-0.168,预测FADD蛋白为亲水蛋白.系统进化树表明,牦牛与哺乳动物亲缘关系近,与鱼亲缘关系最远,符合物种进化规律.FADD蛋白质的二级结构α螺旋、自由卷曲、β-转角和延伸链,占靶蛋白的比例分别为71.29％、22.97％、3.83％和1.91％,与三级结构相符.牦牛FADD蛋白有13.0％位于细胞核、52.2％位于细胞质、8.7％位于细胞外、13.0％位于线粒体、4.3％位于高尔基体和8.7％位于细胞骨架.该研究成功克隆出牦牛FADD基因CDS区,为进一步研究其功能提供了一定理论依据.

关键词：牦牛、FADD基因、生物信息学分析、基因克隆

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分类号：S823.2(家畜)

资助基金：国家重点研发计划项目2018YFD0502303;教育部特色专业建设项目TS11126

在线出版日期：2019-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：7-11