杜泊羊速激肽TAC1基因克隆及生物信息学分析

摘要：

TAC1基因在哺乳动物神经系统中广泛表达,其编码蛋白参与季节性生殖活动的调节.该研究对杜泊羊速激肽(Tachykinin,TK)基因序列进行了克隆及生物信息学分析.结果表明:克隆出杜泊羊TAC1基因组序列,得到3个克隆片段.通过生物信息学分析,克隆片段一的长度为860 bp,经BLAST对比,与云南黑山羊第4号染色体相似度达93％,基因片段缺失4％;克隆片段二的长度为881 bp,经BLAST对比,与云南黑山羊第4号染色体相似度达100％,没有基因片段的缺失;克隆片段三的长度为846 bp,经BLAST对比,与云南黑山羊第4号染色体相似度达98％,没有基因片段的缺失,但有3个突变位点,分别为位于85 bp处的G/C突变、位于88 bp处和629 bp处的G/A突变、位于108 bp处和290 bp处的T/C突变.杜泊羊TAC1基因开放阅读框全长423 bp,共编码140个氨基酸.与GenBank已发表的其他动物TAC1基因参考序列进行比较,结果显示杜泊羊与绵羊、瘤牛、野猪、猕猴、人和大熊猫的TAC1基因同源性分别为98.9％、97.3％、88.1％、85.8％、85.0％、84.5％.通过蛋白质结构预测,发现杜泊羊TAC1基因编码蛋白没有跨膜结构域.

关键词：杜泊羊、TAC1、基因克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：38

分类号：S826.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金项目31472095;国家现代农业肉羊产业技术体系建设专项CARS-38

在线出版日期：2018-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：6-12