羊草microRNA和靶基因的生物信息学预测

摘要：

为鉴定羊草microRNA基因信息并明确其在羊草生长发育、抗逆过程中的调控作用,用羊草small RNA的SRA数据,根据miRBase21.0信息比对,分别获得隶属于39个microRNA家族的141个已知microRNA基因及新注释的6个novel microRNA,并且预测到新microRNA的二级结构为颈环结构.利用单子叶植物ESTs文库预测到1196个靶基因信息,对羊草microRNA基因具有调控作用.Nr注释及COG注释显示多数靶基因参与羊草的信号转导过程,揭示microRNA参与了羊草的生长发育、新陈代谢、逆境调控等.

关键词：微小RNA、羊草、靶基因、生物信息学分析、颈环结构

所属期刊栏目：37

分类号：Q789;S543.9(基因工程（遗传工程）)

资助基金：转基因生物新品种培育重大专项2014ZX08010-002;国家自然科学基金项目31271746、31101091、31201144

在线出版日期：2015-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：5-10