怀有先天性心脏病胎儿的孕妇与正常孕妇肠道菌群的高通量测序分析

摘要：

目的：分析怀有先天性心脏病胎儿的孕妇（ PW组）与正常孕妇（ NW组）的肠道菌群特征。方法：对可能引起个体肠道菌群差异的因素加以控制，2013年6月18号～2013年12月17号收集15例正常孕妇和17例异常孕妇的粪便样本，提取细菌基因组DNA，用PCR方法扩增16S rDNA，进行二代Illumina测序。测序数据应用运算分类单位（ operational taxonomic unit，OTU）聚类分析、多样性分析和分类学分析等生物信息技术分析2类孕妇肠道菌群的结构、多样性和丰度。结果：2类孕妇肠道菌群的高通量测序分析分别得到2696276（ NW组）条和2445530（PW组）条优化序列，测序覆盖深度＞97％。经过97％相似度归并后分别得到77243个（ NW组）和75600个OTUs（ PW组）；菌群多样性分析显示正常孕妇肠道菌群的Chao 1指数和Shannon指数均高于异常孕妇。在最佳分类水平上，正常孕妇肠道菌群由38个科的细菌构成，归属于14个门，以厚壁菌门（ Firmicutes）为主，其次为变形菌门（ Proteobacteria）、放线菌门（ Actinobacteria）等。怀有先心胎儿孕妇肠道菌群构成与正常孕妇相似，最佳分类水平上由33个科的细菌构成，归属于9个门，其中Firmicutes为（75.7±15.8）％， Proteobacteria 为（21.1±17.0）％，Actinobacteria为（2.0±2.1）％。在最佳分类水平上，方差分析显示两者的双歧杆菌科（ Bifidobacteriaceae）和红蝽杆菌科（ Coriobacteriaceae）菌种丰度有明显差异。结论： PW组孕妇与NW组孕妇相比，整体肠道菌群含量明显下降，提示PW组孕妇有更恶劣的肠道环境，其中部分菌群含量存在明显差异。先天性心脏病胎儿的发生可能与孕妇恶劣的肠道微环境有关，其中Bifidobacteriaceae和Coriobacteriaceae在先天性心脏病的预防方面可能有重要作用。

关键词：肠道菌群、Illumina测序、双歧杆菌科、红蝽杆菌科、先天性心脏病

分类号：R363(病理学)

在线出版日期：2015-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：702-706