2020-2021年云南省保山市手足口病病例中柯萨奇病毒A6型基因特征分析

摘要：

目的 分析2020-2021年保山市手足口病柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)基因特征,为手足口病防控策略制定提供依据.方法 收集2020-2021年保山市手足口病病例标本(粪便、咽拭子),应用实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测,CVA6阳性者用逆转录-PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)法扩增其完整VP1基因片段,对扩增产物进行测序,利用序列结果进行型别鉴定并构建系统进化树,进行基因特征分析.结果 2020-2021年保山市共采集手足口病样本424份(粪便样本345份,咽拭子79份),CVA16阳性率1.65％(7/424),EV-A71阳性率3.30％(14/424),其他肠道病毒阳性率 55.66％(236/424),CVA6 阳性23份,阳性率5.42％(23/424);基因进化分析表明,23份CVA6均属于D3亚型,并可分为2个分支(cluster);与 CVA6 原型株 Gdula(AY42176)相比,核苷酸(nucleotide,nt)相似性为 80.63％～84.90％,氨基酸(amino acid,aa)同源性为 91.78％～96.05％;CVA6 VPi 区全长 915 bp,编码 305个氨基酸,本次研究23株病毒,10个变异位点CVA6均产生了变异.结论 2020-2021云南省保山市手足口病流行以其他肠道病毒为主,CVA6流行基因型为D3a亚型.

关键词：手足口病、病原检测、柯萨奇病毒A组6型、基因特征分析

所属期刊栏目：13

分类号：R512(传染病)

资助基金：国家科技重大专项2017ZX10103010

在线出版日期：2023-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：150-154