云南省新型肠道病毒EV80的基因特征分析

摘要：

目的 对云南省3株新型肠道病毒EV80的基因特征进行分析.方法 对3株EV80病毒VP1区基因进行RT-PCR和基因测序,并在NCBI、EBI和DDBJ三大基因库搜索EV80 VP1区基因序列,用MEGA5.0软件计算所得序列的核苷酸和氨基酸相似性,并做基因树进行基因特征分析.结果 共检索到35株EV80的VP1区基因序列,去除序列太短不能分析的2株,对云南株和基因库中共33株进行了分析.33株病毒可分为4个基因型,原型株USA CA67-10387单独聚成一组,为基因型A,云南株和山东株同属基因型D,为中国特有的基因型.结论 虽然目前全世界新型肠道病毒EV80的分离数不多,但其地理分布较为广泛,不同国家、地区的毒株大都为不同的基因型,具有基因多样性特点.本研究对今后中国开展新型肠道病毒EV80的分子流行病学研究和传播链的发现和疫情处置提供了实验室基础.

关键词：新型肠道病毒、EV80、VP1区基因

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分类号：R373.2+4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金81160198

在线出版日期：2014-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：29-33