河北省肾综合征出血热主要流行区鼠携带汉坦病毒基因序列分析

摘要：

目的 了解河北省肾综合征出血热(haemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)主要流行区汉坦病毒主要流行株的基因型及其变异情况.方法 收集2012年河北省东北部地区捕获的啮齿动物,均为褐家鼠,取鼠肺组织,用间接免疫荧光法(indirect immunofluorescence assay,IFA)检测,抗原阳性的标本进行汉坦病毒(Hantavirus,HV)M部分片段扩增并测序,与该地区以往序列及其他部分标准株进行系统发生树及同源性分析.结果 收集164份鼠肺标本,经IFA检测26份阳性,挑选9份有代表意义的标本进行逆转录巢式PCR扩增,9份鼠肺标本经RT-PCR检测均为汉城(SEO)型HV,病毒间变异不大,同源性达95.2％～100.0％.以往测序株与新测序株比较同源性为99.0％～100.0％.系统发生树分析结果表明9份标本均为SEO型HV,且为S3亚型.结论 河北省HFRS主要流行区HV以SEO型为主,亚型为S3亚型.同型HV基因相对保守,具有区域稳定性特征.

关键词：汉坦病毒、肾综合征出血热、RT-nested PCR、系统发生树

所属期刊栏目：3

分类号：R512.8(传染病)

资助基金：河北省科技研究与发展计划项目07276101D-114;河北省自然科学基金资助项目C2007000944

在线出版日期：2014-01-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：435-438