广州市2011年肠道病毒71型VP1基因特征分析
目的 了解广州市2011年肠道病毒71型(EV71)的流行情况及EV71流行株VP1基因特征.方法 用实时荧光PCR方法对手足口病患者标本进行检测,对其中部分EV71阳性粪便标本提取病毒基因组,采用RT-PCR方法扩增VP1区全长基因和序列测定,应用DNA Man和DNA Star软件对序列进行整理分析,用MEGA4.0软件构建系统发生树.结果 1 837份标本中有1 172份肠道病毒阳性,其中EV71阳性357份,占阳性标本的30.46％.7份EV71阳性重症病例与8份EV71阳性普通病例标本EV71 VP1全长为891个核苷酸,编码297个氨基酸.15份标本VP1基因之间的核苷酸同源性为96.7％～99.9％,氨基酸同源性为96.3％～100.0％,重症与普通病例来源的标本之间差异无统计学意义.在系统发生树上,均与C4a亚型代表株处于同一分支,属于C4a亚型,核苷酸同源性为94.1％～95.3％,氨基酸同源性为98.3％～99.0％.结论 广州市2011年流行的EV71病毒为C4a亚型,重症病例和普通病例之间的VP1基因未发现明显的核苷酸变异.
肠道病毒71型、VP1基因、手足口病、基因型
3
R373.2+4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
国家"十二五"艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项2012ZX10004213-005;广州市科信局重大民生攻关专项2012Y2-00020
2013-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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