1株EV71临床分离株的全基因组序列测定和结构分析及对乳鼠致病性研究

摘要：

目的 利用课题组前期分离获得的EV71临床分离毒株,对其全基因组序列测定及分析,建立EV71感染的动物模型,分析其基因序列与致病性的关系.方法 利用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(RACE)分段扩增EV71全长基因,对各扩增片段进行克隆和测序；用软件MEGA 5、RNAstructure 5.3进行基因组结构及特点分析；腹腔注射毒株建立EV71感染的ICR乳鼠模型.结果 得到3个部分相互重叠并涵盖全基因组的重组质粒,测序后拼接成全基因序列,命名为EV71 BC08株存入GenBank (JQ514785).序列分析表明BC08株为EV71 C4a基因亚型,其5′非编码区(5′ UTR) A627点突变可能影响病毒5′ UTR二级结构.BC08株能感染乳鼠并导致其出现神经系统症状,病理学研究表明受染乳鼠肌肉和大脑组织有病毒VP1蛋白表达.结论 BC08毒株基因组全长7 406 bp,为C4a亚型,与近年我国EV71流行株有很高的同源性(＞95％),但A627点突变可能影响病毒5′ UTR二级结构及功能.BC08毒株可感染乳鼠并致病,这对该临床分离株的致病能力提供了直接证据,也为建立EV71感染的乳鼠模型奠定基础.

关键词：肠道病毒71型、基因型、病毒致病性、乳鼠模型

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分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划项目2007AA02Z317;国家自然科学基金21172012/b020601

在线出版日期：2013-01-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：419-425