血浆HIV-1 RNA与干血斑HIV-1 DNA基因型耐药检测比较

摘要：

目的 通过对不同病毒载量的同一研究对象同时进行血浆HIV-1 RNA与干血斑HIV-1 DNA的基因型耐药检测并对结果进行比较,探讨HIV-1 DNA用于耐药检测的可行性和用途.方法 2021年12月采集云南省、广西壮族自治区及新疆维吾尔自治区接受ART后1年以上的HIV/AIDS患者静脉血5 mL,EDTA抗凝,分离血浆和制备成干血斑样本,分别提取病毒DNA和RNA进行pol区扩增,比较两种方法的扩增效率;并对同时扩增成功的序列利用MEGA7构建系统进化树并分析序列一致性.利用斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药位点分析,比较耐药性结果.结果 209例样本中,来自云南82份(39.2％),来自广西壮族自治区69份(33.0％),来自新疆维吾尔自治区58份(27.8％).105 例 VL＜20 拷贝/mL,25 例 20 拷贝/mL≤VL＜200 拷贝/mL,42 例 200 拷贝/mL≤VL＜1 000 拷贝/mL,37 例 VL≥1 000拷贝/mL.不同病毒载量的样本分类中,使用血浆中HIV-RNA pol区扩增成功率分别为12.4％、28.0％、69.0％、89.2％;使用干血斑中HIV-DNA pol区扩增成功率分别为39.0％、52.0％、59.5％、73.0％;血浆结合干血斑各组的扩增成功率为41.0％、56.0％、76.2％、89.2％.两种耐药检测方法同时扩增成功66例,耐药结果完全一致为98.5％,序列一致性99.7％.其中有58例(58/66,87.9％)配对样本耐药位点完全一致,8例配对样本耐药位点不完全一致.耐药位点不完全一致的配对样本中仅1例导致耐药结果不同,其他主要由混合碱基导致但未对耐药结果产生影响.结论 应用干血斑HIV-1 DNA进行基因型耐药检测可以弥补目前血浆HIV-1 RNA耐药检测不足,特别是对病毒载量＜1 000拷贝/mL的样本,能够提高耐药检测效率.同时二者检测结果基因序列与耐药位点的一致性很好.结合干血斑样本容易制备、保存与运输的优点,提高了在偏远欠发达地区进行耐药监测的可及性.

关键词：1型艾滋病病毒、病毒载量、脱氧核糖核酸、耐药、干血斑

所属期刊栏目：29

分类号：R512.91;R373.9(传染病)

资助基金：国家科技重大专项2015ZX10001001002

在线出版日期：2023-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：9-13