温州市2019年新诊断HIV-1感染者的病毒基因型分析

摘要：

目的 分析温州市2019年新诊断HIV-1感染者的病毒基因型,揭示亚型分布特点及流行趋势.方法 采集232例HIV-1感染者血浆样本,采用巢式PCR扩增pol区基因,于Los Alamos HIV database下载参考序列,构建系统进化树确定基因亚型,利用HIV Blast工具进行同源性分析.结果 获得199例感染者的pol区基因序列,以异性性传播(61.3％,122/199)为主,其次是同性性传播(23.1％,46/199).同性性传播感染者以19～49岁(78.3％,36/46)的青壮年为主,多为无配偶.共检出8种基因亚型,以CRF07_BC (47.2％,94/199)和CRF01_AE(29.1％,58/199)为主;其次是CRF08_BC(6.5％,13/199)、C(6.0％,12/199)、B(4.5％,9/199)、CRF85_BC(2.5％,5/199)、CRF55_01B(1.5％,3/199)和CRF59_01B (0.5％,1/199).检出2种独特重组型(URFs),分别是URF (CRF01_ AE/BC)(1.0％,2/199)和URF(B/C)(1.0％,2/199).发现20个传播簇,总成簇比例为20.6％(41/199),CRF07_BC、CRF0 I_AE和CRF08_BC的传播簇分别为6个、8个和2个;C、CRF55_01B、B和URF(CRF01_AE/BC)的传播簇均为1个.结论 温州市2019年新诊断HIV-1感染者病毒基因亚型多样,以CRF07_BC和CRF01_AE为主,C亚型占比偏高,成簇率约20％.应加强对HIV-1亚型和传播簇的监测,掌握动态变化趋势.

关键词：1型艾滋病病毒、基因型、传播簇、同源性

所属期刊栏目：27

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：温州市科技局项目;温州市科技局项目

在线出版日期：2021-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：337-342