蛋白质相互作用网络功能模块检测的研究综述
蛋白质相互作用(Protein-protein interaction, PPI)网络是生命活动中一种极其重要的生物分子关系网络,利用计算方法从PPI 网络中检测功能模块是目前生物信息学中一项重要的研究课题。本文首先总结了功能模块检测过程的基本流程,说明了预处理和后处理的作用；其次,提出了一种模块检测方法的分类体系,并对其中一些代表性的检测算法进行了阐述；再次,给出了模块检测常用的数据库、评价指标和相关软件工具,并通过实验对代表性算法进行了性能对比。最后,通过对该领域挑战性问题的分析预测了模块检测未来的研究方向,以期对相关研究提供一定的参考。
蛋白质相互作用网络、功能模块检测、检测流程、分类体系、性能对比
R91;O62
国家重点基础研究发展计划973 计划2014CB744601;国家自然科学基金61375059，61332016;教育部博士点学科专项科研博导类基金20121103110031;北京市教委科研计划重点项目北京市自然科学基金重点B 类项目 KZ201410005004 资助@@@@ Supported by National Basic Research Program of China 973 Program2014CB744601;National Natural Science Founda- tion of China61375059, 61332016;Specialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education201211031100 31;the Beijing Municipal Education Research Plan Key Project Beijing Municipal Fund Class BKZ201410005004
2014-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共17页
577-593
