茯苓基因组中MYB转录因子基因家族鉴定及表达分析

摘要：

目的 从全基因组水平挖掘茯苓Poria cocos MYB转录因子基因家族成员,并分析其在菌丝、菌核等部位及茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)诱导后菌丝中的表达模式,以期发现与茯苓发育及次生代谢物生物合成调控相关的MYB转录因子.方法 基于茯苓基因组数据,通过序列比对及保守结构域分析挖掘MYB转录因子基因,利用ExPASy在线工具预测分析MYB蛋白质理化性质,利用MEGA 7.0软件构建茯苓MYB蛋白进化树,利用MEME在线工具分析保守基序,利用Plant CARE进行启动子区顺式作用元件分析,通过MeJA诱导菌丝并采用qRT-PCR方法检测基因相对表达量.结果 在茯苓基因组中共鉴定到10个含有特征性保守结构域的MYB转录因子,其中4个属于1R类型,4个属于2R类型,2个属于4R类型.进化树及保守基序显示,相同进化枝的MYB蛋白所含基序类型相似.启动子区预测分析发现了多类激素及逆境响应顺式作用元件.基因表达谱分析显示有2个基因(PcMYB7和PcMYB8)在菌丝中的表达量高于菌核中的表达量,而PcMYB9则是在菌核中表达量相对较高.MeJA诱导后,有3个基因(PcMYB5、PcMYB6和PcMYB7)在诱导3 h时表达量明显上调.结论 从茯苓全基因组中系统鉴定MYB转录因子基因家族,为进一步研究MYB基因在调控茯苓发育及次生代谢物合成方面的生物学功能奠定基础.

关键词：茯苓、MYB转录因子、全基因组鉴定、生物信息学分析、基因表达分析

所属期刊栏目：54

分类号：R286.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;中国医学科学院医学与健康科技创新工程

在线出版日期：2023-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：245-253