藜芦bHLH转录因子分析鉴定

摘要：

目的 基于转录组数据,利用生物信息学方法鉴定藜芦Veratrum nigrum bHLH转录因子基因家族,并作初步分析.方法 通过隐马可夫模型从藜芦转录组序列中筛选bHLH基因,并使用ExPASy、MEME等在线网站及MEGA、TBtools等软件对藜芦bHLH进行理化性质、保守基序等可视化分析.结果 在藜芦转录组中共鉴定到72条bHLH转录因子,VnbHLH转录因子氨基酸数目为105～692,等电点介于4.69～11.47,相对分子质量为11 071.2～77 795.3,亚细胞定位分析显示VnbHLH均定位于细胞核中;系统发育分析将VnbHLH转录因子分为6个亚族,VnbHLH在不同组织中表达差异显著,Vn_54312、Vn_14037在根中表达较高,推测其可能参与了藜芦植物根部某些生物碱的合成.结论 根据转录组数据分析了药用植物藜芦中的bHLH转录因子基因家族,有助于下一步对藜芦bHLH转录因子家族功能预测及验证.

关键词：藜芦、转录组、bHLH转录因子、系统进化、基因表达

所属期刊栏目：53

分类号：R286.12(中药学)

资助基金：吉林省农业科技创新工程项目CXGC2017ZY029

在线出版日期：2022-08-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：4476-4485