人参bZIP基因家族生物信息学分析

摘要：

目的 通过人参bZIP基因家族生物信息学分析,为人参功能基因开发利用提供理论依据.方法 运用PlantTFDB数据库预测人参基因组中bZIP基因;通过ExPASy网站得到人参bZIP基因家族信息和特征;使用MEME网站对PgbZIP基因家族保守基因序列进行分析;运用MEGA软件建立PgbZIP基因家族系统进化关系;利用TBtools软件进行PgbZIP表达分析.结果 人参基因组中含有157个bZIP基因家族成员,其中152个定位在细胞核,其余5个分别定位在叶绿体和内质网,相对分子质量在14009.93～83 440.38,等电点在4.53～10.05,氨基酸数目在120～760aa,除PgbZIP157以外,均为亲水蛋白.PgbZIP131在干旱胁迫下的表达量为83.47;PgbZIP99在根和盐胁迫条件下表达量均最高,分别为119.82和117.86;PgbZIP117在叶中表达量为48.54;花中PgbZIP106表达量最高为79.55;成熟果实中表达量最高是PgbZIP118,为119.32;PgbZIP101在未成熟果实中的表达量最高,且为65.32.结论 推测PgbZIP99与同源基因AtbZIP11功能相似,可以调控根的分生组织活性;PgbZ1P131在干旱胁迫条件下表达量最高,推测PgbZIP131对干旱胁迫有重要调控作用;A亚族成员ABF2/AREB1(AtbZIP36)、ABF3(AtbZIP37)、ABF4/AREB2(AtbZIP38)参与干旱胁迫和盐胁迫调控,推测与A亚族成员具有同源关系的PgbZIP74、PgbZIP132,PgbZIP122、PgbZIP112在干旱胁迫和盐胁迫条件下具有相似调控作用.

关键词：人参、bZIP、生物信息学、基因家族、盐胁迫、干旱胁迫

所属期刊栏目：53

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：黑龙江省头雁团队项目;黑龙江中医药大学科研基金项目

在线出版日期：2022-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2786-2794