山茱萸萜类合成途径关键酶HMGR1基因的克隆与分析

摘要：

目的 克隆山茱萸Cornus officinalis HMGR1的cDNA序列并进行生物信息学分析.方法 以山茱萸转录组数据中unigene c100572_g1序列为参考,在其开放阅读框两端设计特异引物,经实时荧光定量PCR(RT-PCR)扩增、连接pTOPO-T载体克隆并测序,获得CoHMGR1基因的cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行相关分析.结果 CoHMGR1基因长2 116 bp,含长度为1 338 bp的完整开放阅读框(ORF),编码445个氨基酸,为疏水性蛋白.多序列比对和亲缘关系分析显示,CoHMGR1基因编码的氨基酸序列与喜树的序列相似性较高,达79.56％.结论 首次对山茱萸叶片和果实进行比较转录组测序的基础上,成功克隆并分析了CoHMGR1基因,为进一步研究CoHMGR1蛋白的功能及山茱萸萜类合成途径的分子机制奠定基础.

关键词：山茱萸、萜类、CoHMGR1、克隆、实时荧光定量PCR、序列分析

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分类号：R286.2(中药学)

资助基金：国家自然科学基金项目;中央本级重大增减支项目“名贵中药资源可持续利用能力建设项目”;河南省中药产业技术体系建设专项资金;棉花生物学重点实验室开放课题资助

在线出版日期：2020-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：4733-4738