基于DNA条形码的多花黄精系统发育和变异位点分析研究

摘要：

目的 对来自不同地域的多花黄精野生资源的核糖体内转录间隔区2(internal transcribed spacer2,ITS2)和psbA-trnH基因间隔区序列进行系统发育分析,探索不同地理来源的多花黄精资源的遗传多样性和亲缘关系.方法 用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)的方法扩增获得多花黄精ITS和psbA-trnH的核酸序列,与美国国家技术信息中心(NCBI)相对应的核酸序列比对获得多花黄精ITS2和psbA-trnH核酸序列.用邻接法(Neighbor joining)构建系统发育树,用Kimuratwo-parameter (K2-P)模型分析遗传距离,用Mega和DNAman软件进行多重比对分析.结果 安徽青阳样品的ITS2序列为224 bp,其余24份样品的ITS2序列均为225 bp,福建泰宁的1份样品为620 bp,其余24份多花黄精样品的psbA-trnH序列均为621 bp,2个序列分别存在7个和4个变异位点.采用ITS2序列构建的系统发育树将25份资源分为2个大的类群,湖南和贵州的5份资源种群聚为一类,其他20份资源聚为一类,遗传距离显示来自贵州花溪、剑河的样品和来自福建建阳的遗传距离最大;采用psbA-trnH序列构建的系统发育树则无法将不同地域多花黄精资源区分开.结论 系统发育和变异位点分析为多花黄精资源的进化研究、道地性评价奠定了理论基础,变异位点的分析可用于相关资源的鉴定.

关键词：多花黄精、ITS2、psbA-trnH、系统发育、PCR、遗传多样性

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：福建省农业科学院药用植物创新团队项目;热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室开放课题;工信部中药材生基地建设项目“多花黄精规范化种植及野生抚育产业基地建设”

在线出版日期：2020-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：4003-4010