云南草果种质资源DNA条形码序列分析

摘要：

目的 筛选与评价适用于云南草果居群的DNA条形码.方法 以云南省草果种质资源为样本对ITS、psbA-tmH、marK、rbcL和ycf1 5条DNA条形码常用序列进行筛选与评价,并对草果居群进行扩增,测序,测序序列用Genestar进行拼接,然后用Mega进行数据处理,并对草果多样性及其鉴定进行分析.结果 引物ITS5和ITS4对草果的扩增片段长度大约为520 bp;rbcLa-F和rbcLa-R对草果的扩增片段长度大约为498 bp;引物ycf1-bF和ycf1-bR对草果的扩增片段长度大约为800 bp;引物psbA-tmH-1F和psbA-tmH-1R对草果的扩增片段长度大约为400 bp;引物matK-2F和matK-2R对草果的扩增片段长度大约为470 bp.扩增及测序的成功率均较高,结果大多可用.通过对草果ITS、psbA-tmH、matK和ycfl序列的扩增结果进行分析,草果与其他豆蔻属植物都可以被清晰地区分开;ITS序列所有样本分为MG5白花草果居群和其他居群;psbA-trnH序列所有样本分为MG5白花草果居群,MG6黄花草果居群和其他居群;matK序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果样本扩增失败;ycf1序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果居群与其他22个草果居群聚为一支;rbcL序列对所有样本的扩增均一致.结论 ITS、marK、psbA-trnH及ycf1序列均能将草果与其他同属植物进行准确区分;MG6的matK、psbA-trnH及ycf1序列发现了序列位点的变异,为草果品种的选育做出贡献.ITS和psbA-trnH序列可将黄花和白花草果序列区分开;草果白花黄花所有样本rbcL序列无任何变异,且用rbcL序列无法鉴别草果与其他同属植物,可将其舍去.

关键词：草果、遗传多样性、亲缘关系、DNA条形码、ITS序列、psbA-tmH序列、matK序列、ycf1序列

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家自然科学草果居群的分子鉴定及种质资源评价;云南省社会发展科技计划项目:云南草果种植加工关键技术研究;示范;云南省科技计划项目:云南省芳香生物工程技术研究中心建设

在线出版日期：2020-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：6091-6097