不同品种灰毡毛忍冬ACS3基因克隆、表达及生物信息学分析

摘要：

目的 分别克隆灰毡毛忍冬野生型与湘蕾型ACS3基因,并进行生物信息学和表达模式分析.方法 筛选灰毡毛忍冬转录组数据库中与ACS蛋白同源性较高的Unigene序列,设计引物,利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)及RACE技术对该Unigene进行全长克隆;用生物信息学软件分析蛋白的理化性质、结构域和同源性等特性;借助qRT-PCR检测1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶(ACS3)基因在不同品种、不同花期灰毡毛忍冬中表达模式.结果 从灰毡毛忍冬野生品种及湘蕾品种中分别克隆得Lm-ACS3 (GenBank:MH724196)及Lm-XL-ACS3 (GenBank:MH724197),开放阅读框长度均为1 452 bp,编码483个氨基酸,包含保守的Aminotran_1_2结构域,与其他植物的ACC合酶具较高相似度;qRT-PCR结果显示,野生型ACS3基因不同花期间表达差异显著,从花期3开始呈整体明显上升趋势,湘蕾型中花期间表达差异相对较小.结论 分别克隆得到灰毡毛忍冬野生型和湘蕾型ACS3基因,该基因在2品种中具不同表达模式;推测ACS3基因或为导致灰毡毛忍冬不同品种间差异表型的可能功能基因之一,为进一步验证该基因在调控蕾期长短及花表型的生物学功能提供实验基础.

关键词：灰毡毛忍冬、乙烯生物合成、1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶、基因克隆、生物信息学、实时荧光定量PCR

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81673546;国家自然科学基金资助项目81203007;中央引导地方科技发展专项资金项目2017XF5044;湖南省自然科学基金资助项目2017JJ3237;湖南省教育厅资助科研项目16B193;湖南省科技厅重点研发项目2017SK2124;国家中医药管理局中药标准化项目ZYBZH-Y-HUN-24;湖湘中药资源保护与利用2011协同创新中心项目湘教通[2015] 351;湖南中医药大学中药学一流学科项目校行科字[2018]3号

在线出版日期：2019-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2154-2164