基于Illumina MiSeq高通量测序分析黄芪内生细菌多样性

摘要：

目的 分析黄芪内生细菌群落多样性,为筛选菌种发酵转化黄芪中活性成分的定向炮制工艺研究提供参考依据.方法 应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定黄芪内生细菌的16 S rDNA V3-V4区域序列并进行物种丰度等生物信息分析.结果 获得有效序列40 051条,操作分类单元(OTUs) 967个,测序数量接近于饱和,测序数据量合理.黄芪内生细菌主要分布于Anderseniella属、芽孢杆菌属Bacillus、伯克氏菌属Burkholderia、不动杆菌属Acinetobacter、寡养单胞菌属Stenotrophomonas、海洋芽胞杆菌属Oceanobacillus 6个属.结论 黄芪内生细菌群落多样性较低,Anderseniella属和芽孢杆菌属Bacillus是黄芪内生细菌的优势种群.

关键词：Illumina MiSeq、黄芪、内生细菌、高通量测序、多样性

所属期刊栏目：49

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家中医药管理局“中药炮制技术传承基地建设”项目2015132

在线出版日期：2018-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2640-2645